Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6P435 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6P435 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6P435 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6P435 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6P435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6P435 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6P435 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6P435 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6P435 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6P435 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6P435 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6P435 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6P435 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6P435 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms