Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 214.45□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 48.1
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PRPF8Q6P2Q9 PTEN-203ENST00000472832 644 ntTSL 20.81□□□□□ -2.287e-13■■■■■ 48.1
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PRPF8Q6P2Q9 TOP2B-207ENST00000491510 584 ntTSL 4-0.41□□□□□ -2.477e-13■■■■■ 48.1
PRPF8Q6P2Q9 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.487e-13■■■■■ 48.1
PRPF8Q6P2Q9 DPF2-203ENST00000444314 940 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 48.1
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.781e-21■■■■■ 48
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PRPF8Q6P2Q9 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-15■■■■■ 48
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