Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JMJD6Q6NYC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JMJD6Q6NYC1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JMJD6Q6NYC1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms