Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RWDD4Q6NW29 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms