Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWSAP1Q6NVH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms