Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMBOX1Q6NT76 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms