Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALGAPA1Q6GYQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms