Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA3Q6AZY7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms