Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG16L1Q676U5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms