Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG9BQ674R7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms