Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLX4IPQ5VYV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms