Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SPATA1Q5VX52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPATA1Q5VX52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA1Q5VX52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms