Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BROXQ5VW32 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms