Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
EFCAB2Q5VUJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms