Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf53Q5VUE5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf53Q5VUE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf53Q5VUE5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms