Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACHD1Q5VU97 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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