Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRIP1Q5VSL9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRIP1Q5VSL9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 495.6 ms