Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIF1Q5UIP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms