Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD5Q5TGI4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms