Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms