Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC9C2Q5TAH2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC9C2Q5TAH2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9C2Q5TAH2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms