Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC18Q5T9S5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms