Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf220Q5T0J3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms