Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HP1BP3Q5SSJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms