Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms