Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR44Q5JSH3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms