Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRB2Q5IJ48 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB2Q5IJ48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms