Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR3Q5GH77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms