Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF6Q58WW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms