Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms