Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLE1Q53GS7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms