Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFTN2Q52LD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms