Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3BQ502W6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3BQ502W6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms