Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms