Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP13-3Q3SY46 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms