Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms