Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms