Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STX1AQ16623 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX1AQ16623 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms