Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACKR1Q16570 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACKR1Q16570 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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