Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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