Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK5Q16478 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK5Q16478 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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