Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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