Protein–RNA interactions for Protein: Q15633

TARBP2, RISC-loading complex subunit TARBP2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2Q15633 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TARBP2Q15633 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TARBP2Q15633 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TARBP2Q15633 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms