Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIV2LQ15477 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms