Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PUM3Q15397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUM3Q15397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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