Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NECTIN1Q15223 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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