Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD3Q15059 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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