Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 217.99■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PNPLA7-207ENST00000492278 5308 ntTSL 217.97■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 217.96■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TUBGCP6-205ENST00000473946 1733 ntTSL 217.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 517.94■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NR1I2-204ENST00000474090 977 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RMDN3-207ENST00000558777 2139 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-224ENST00000515526 498 ntTSL 317.69■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BAHCC1-202ENST00000578541 814 ntTSL 217.69■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-212ENST00000583320 965 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COQ8B-205ENST00000593724 2255 ntTSL 217.66■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZNF526-202ENST00000597945 573 ntTSL 417.65■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM243-204ENST00000455575 544 ntTSL 217.62■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-213ENST00000602113 1691 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 317.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR97-206ENST00000534167 7119 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZW10-203ENST00000538209 892 ntTSL 317.5■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.397e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EHMT1-208ENST00000475564 2782 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TCF3-207ENST00000586164 409 ntTSL 317.41■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GCN1-203ENST00000547369 595 ntTSL 317.32■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RMDN3-211ENST00000560905 1008 ntTSL 217.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-207ENST00000588283 877 ntTSL 317.19■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-208ENST00000557630 581 ntTSL 317.1■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 517.1■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-219ENST00000511845 554 ntTSL 416.98■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NEK8-206ENST00000584342 828 ntTSL 216.94■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 KATNB1-202ENST00000562542 512 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-203ENST00000485076 554 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.296e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 316.86■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-210ENST00000505336 534 ntTSL 416.84■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-207ENST00000464489 5901 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 216.78■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 316.69■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BRF1-208ENST00000546997 1999 ntTSL 216.65■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C14orf80-220ENST00000551538 4437 ntTSL 216.56■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTSE1-204ENST00000491863 751 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TBC1D13-203ENST00000466056 839 ntTSL 316.47■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 416.45■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-223ENST00000479383 873 ntTSL 316.3■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PIGG-204ENST00000502311 1189 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-216ENST00000510917 453 ntTSL 316.12■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-211ENST00000505456 878 ntTSL 516.12■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-205ENST00000509692 1646 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.146e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STK33-209ENST00000454443 562 ntTSL 415.9■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.136e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-210ENST00000484337 753 ntTSL 315.85■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 STK33-215ENST00000526517 921 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAD9A-204ENST00000535644 1624 ntTSL 315.73■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SRM-204ENST00000475189 545 ntTSL 215.63■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.086e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 215.42■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 415.41■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-204ENST00000585435 437 ntTSL 315.33■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DYRK1B-206ENST00000600611 657 ntTSL 515.28■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 47.1
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