Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GAPVD1Q14C86 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GAPVD1Q14C86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
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