Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCINQ13939 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCINQ13939 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCINQ13939 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCINQ13939 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCINQ13939 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCINQ13939 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCINQ13939 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCINQ13939 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCINQ13939 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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